君子兰是虫害比较少的花卉之一。如果出现高温、高湿，通风又不好的情况，它也会发生虫害。
目前发现的较普遍的害虫叫“吹棉介壳虫”（即棉花虫，雌虫体长3毫米，体躯橘红色；雄成虫橙黄色、扁平椭圆形），一年四季都有发生。开始出现在假磷茎处，如治疗不及时，很快会蔓延至叶片各部，它会把尖锐的口器刺到植株的组织内部吸取养分，使叶片萎蔫，植株衰弱，丧失生命力。
预防君子兰虫害发生的根本办法是使植株生长在温度适宜、通风良好的环境中。另外，在没发生虫害前可施用“百治屠”预防。一旦发现，要立即用软布沾肥皂水或“百治屠”擦患处。严重的也可用呋喃西林擦洗或用1%的敌敌畏水将纱布浸湿铺在花盆土面上二三天，害虫即可消除。但注意不要用乐果等农药灭虫，以免引起药害。