防治方法：及时发现并清除发病区中心的病株或中心病区，可采用开沟隔离病区的办法阻止菌丝发展。适当间伐以减少林内温度，湿度，保持林内卫生。发现染病后，及时清除病根。对整条腐烂根，须从根基砍除，并清除病部，用1%～2%硫酸铜溶液消毒，也可用40%五氯硝基苯粉剂配成1:50的药土，混匀后施于根部。也可在树干基部挖3～5条辐射状沟，然后浇灌50%甲基拖布津可湿性粉剂800倍液或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液或20%甲基立枯磷乳油1000倍液。
松根朽病发病规律：该病阳坡重于阴坡-山中，山下腹林重于山上腹林。一般情况下，林分郁闭度大，林内湿度大，并且根与根相接触的机会增多，有利于该病的传播蔓延。但在卫生状态好，又不过分潮湿的林分内，即使郁闭度大，发病也不重。因此发病的轻重，即与地形，土壤水分有直接关系，也与林分经营的好坏有关系。