一、水质标准互不协调
目前大多数环保部门根据《水十条》的要求治水，以为污水处理后排放的水达到一级a就万事大吉了。殊不知，环保部一级a的排放标准尚不及水利部关于水源水质要求的五类水标准。
国家规定，饮用水的水源必须优于三类水。
设计标准的人当时可能以为，接纳排放水的河流与饮用水的水源地是互不相干的，实际情况并非如此。比如福建的九龙江，上游污水厂处理后排放的水，会成为下游自来水厂的水源。同一个水体，上游污水处理厂如果仅以一级a为标准，必然不可能把影响人体健康的化学微污染物完全去除，而下游自来水厂又没有去除化学微污染的净水工艺，由此导致饮用水安全无法得到保障，结果必然是老百姓遭殃。
二、污水处理末梢把关
水污染通常源于人类的生产生活活动，主要包含如下三个方面：1) 生活污染：在居民生活中产生的污染物造成的水污染, 如含磷洗衣粉的污染;2) 工业污染：在工业生产中产生的污染物造成水污染, 如造纸厂、采矿场排出的有毒废水;3) 农业污染：农业生产过程造成的水污染，如种植业使用农药、化肥，养殖业使用激素、抗生素等。
目前地方政府部门把所有的压力都传导给辖区所在的污水处理厂，指望由其末梢把关、达标排放。实际上，目前污水处理厂普遍采用的工艺均无法应对复杂的进水条件。举个例子，许多非理工背景的地方官员以为只要进水的cod、bod符合规定，污水处理厂的出水就必然合格。但他们有所不知，许多工业园区排放到市政管网中的污水，由于碳氮比严重失调，结果污水处理厂无法处理，双方互相指责，引发许多纠纷。
三、饮水安全指望水厂
随着人民生活水平的不断提高，老百姓对饮用水的要求越来越高。各级政府也把提升饮用水质、保障饮水安全列入政府的工作计划与财政预算。因此，不时会看到一些地方政府发布公告，耗费巨资升级改造自来水厂。地方政府的本意与愿望是良好的，值得肯定。然而，实际的效果却值得商榷，因为影响自来水水质的因素跟水源水质、制水工艺、输水管网、高楼水箱等密切有关。
就水源水质而言，目前的主要问题是或多或少都遭遇了化学微污染，传统的四步法净水工艺对此无能为力，但即使采用先进的超滤膜工艺加以提升改造，也仅仅是在改善澄清度与去除微生物方面卓有成效，而对于水源水质中可能含有的化学微污染束手无策。进一步地说，即使水厂出水达标，经过参差不齐的输水管网、管理欠佳的高楼水箱，到了居家住户的水龙头，自来水的安全性已经无法保障了