一、种子清选：种子处理是实现花卉的工厂化育苗的关键性技术之一，清选是为清除种子中的夹杂物，如鳞片、果皮、果柄、枝叶、碎片、瘪粒、病粒、土粒、其它种类的种子等，以便于播种的顺利进行。一般少量种子可用手选。种子量比较多时可用风选、筛选和水选。
1、风选：适用于中小粒种子，利用风、簸箕或簸扬机净种。少量种子可用簸箕扬去杂物。
2、筛选：用不同大小孔径的筛子，将大于小于种子的夹杂物除去，再用其它方法将与种子大小等同的杂物除去。筛选可以清除一部分小粒的杂质，还可以用不同筛孔的筛子把不同大小的种粒分级。由于种子的大小不同种子的发芽出苗能力不同，幼苗的生长势也不同。种子分级播种，即把大小一致的种子分别播种，可保证花卉的幼苗发芽出苗整齐，生长势一致，便于管理。实践证明，在同一来源的种子中，种子粒越大越重者，幼苗越健壮，苗木的素质越好。将同级的种子进行播种，出苗的速度整齐一致，苗木的生长发育均匀，分化现象少。不合格率降低，对生产的意义很大。分级工作通常与净种同时进行，亦可采用风选、筛选及粒选方法等进行。
3、水选：一般使用于大而重的种子，如栎类、豆科植物的种子，利用水的浮力，使杂物及空瘪种子漂出，饱满的种子留于下面。水选一般用盐水或黄泥水。水的比重为1.1～1.25克/cm3，把漂浮在上面的瘪粒和杂质捞出。水选后可进行浸种。水选后不能曝晒，要荫干。水选的时间不宜过长。
二、种子消毒：种子消毒常用杀菌剂、杀虫剂、及杀菌与杀虫混剂处理等。其作用为：
①防治系统性病害的传播流行；
②预防烂种和秧苗枯萎病；
③促进发芽；
④预防贮藏性病害；
⑤防治土传性病害等等。
其目的在于提高种子发芽率，出苗整齐，促苗生长，缩短育苗期限，提高苗木的产量和质量。
1、物理消毒法：种子消毒的方法有物理法如日光曝晒、紫外光照射、温汤浸种等。日光曝晒仅适于哪些在日光曝晒下不易丧失发芽率的花卉种子。温汤浸种，在我国已有悠久的历史，北魏时期的贾思勰在他的《齐民要术》中就有用热水浸种稻谷的记载。baker(1947)也提出用温汤浸种法防治园艺植物猝倒病，winter不能进入，后者不能排出，阻耐气体交换，影响种子内部的生物化学变化，和胚的生长，禾本科植物和棉子等种子的休眠，主要是这一原因造成的。
③种皮的机械约束作用：如核桃、杏、桃、李、杨梅、椰子、泽泻、荠属、独行菜等由于种皮的机械约束力作用，使种胚不能向外生长，种子长期处于吸胀饱和状态，直至种皮得到干燥时，细胞壁胶体性质发生变化后，才能萌发。种皮坚韧、致密、或表面具有革质或蜡质的种子，往往容易限制种子的萌发而成为休眠的原因。
2、抑制发芽物质存在:有些植物的果皮、胚乳、或胚部含有抑制发芽的物质存在，如酚类物质、氨、乙烯、氰化氢、有机酸等。近年的研究证明,主要的抑制物质是脱落酸(aba)。在胚内的aba含量和休眠的深度成正比。在休眠的种子中脱落酸的含量很高,随着休眠的解除,脱落酸的水平逐渐下降。如，红松种皮含有单宁，约5.5％，抑制种子发芽。影响种子发芽的因素可能是多种因素综合作用的结果。另据报导,杨树种皮中有脱落酸存在,影响种子的萌发,在萌发前将种子浸泡在清水中,将脱落酸溶出后种子就能萌发。
3、胚需要后熟:
①生理后熟：种子的胚在还未完全成熟，在适宜的条件下，即使剥去种皮，也不能萌发。这类种子一般需要在低温和潮湿的条件下经过几周至数月之后才能萌发生长。这种现象称生理后熟。如繁枝苋、菊、矮牵牛、香豌豆、四季樱草、三色堇、一品红、楼斗菜等，需将种子在低温下保存一定的时间后才能发芽。一般林木的种子在采收后要在低温潮湿的环境条件下经历一个冬季，到翌年春天才能发芽。如板栗、苹果等。
②形态后熟：是有些种子休眠的原因之一。有些植物的种子如银杏、兰花冬青的种子在采收时，种子已表现出成熟的形态特征，但其胚尚未分化完善，种胚还很小，需要在适宜的条件下继续完成器官分化的现象称为形态后熟。此类植物还有：毛茛、水曲柳、白蜡树、野蔷薇、冬青、卫矛等。种子萌发需要严格的环境条件，如温度、水分、空气等。如大岩桐的种子发芽的适宜温度为24℃，一般盆播时还要覆盖塑料膜以保持盆土的湿度。对于休眠期长的种子或休眠期不一致的种子在播种前进行必要的处理以打破休眠，否则种子发芽不整齐。
五、种子催芽：种子摧芽是解除种子休眠和促进种子发芽的措施,通过摧芽解除种子休眠,使种子适时出土,出土整齐,提高发芽率和提高成苗率,减少播量，提高苗木的产量和质量。
1、种子发芽的条件：
⑴水分：种子必须吸收一定量的水分才能萌发。水分是发芽的首要条件，只要有了水分，才能使种子膨胀，种皮破裂，使种子内的水解酶类激活，从而使种子内部的贮藏性物质转化为结构物质，供种子萌发之用。
⑵温度：温度对种子萌发的影响很大，种子内部的生理生化作用，是在一定的温度下进行的。种子萌发也有“三基点”温度。即最高、最低、和最适温度。种子在最高和最低温度范围之外容易失去发芽力，高温使种子变性，过低温度使种子遭受冻害。最适温度不是生长发育最快的温度，温度高生长发育快，但幼苗细弱。而在幼苗生长发育健壮时的温度，称最适温度。
①变温处理种子，可以激发种子内水解酶的活性，有利于种子内营养物质的转化，使贮藏性物质转化为结构性物质；变温还可使种皮因胀缩而破裂，利于种子的气体交换，促进萌发。