在4至5月和9至10月赤枯病的发病期，可喷施1比1比200倍波尔多液，或50%退菌特可湿性粉剂500至1000倍液，25%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或抗菌剂401的800倍液。水杉赤枯病一般从水杉下部枝叶先发病，逐渐向上发展蔓延，最后导致全株枯死。感病枝叶，初期产生褐色小斑点，后扩展为深褐色，后小枝和枯枝变褐色枯死。病害还可蔓延到绿色的小枝，形成下陷的褐色溃疡斑，包围主茎，则导致上部枯死;或不包围主茎，但长期不能愈合，随着主茎生长，溃疡处深陷主干，形成沟腐，幼树基干部产生不规则凹沟，成为畸形。在潮湿条件下，病斑产生黑色小点。为病原菌的子实体。
预防水杉赤枯病，要严格执行植物检疫，禁止病苗引进新区，发现病苗应立即清除烧毁。
种植苗木水要过密。要求通风透光，降低空气中湿度，增施磷钾肥，少施氮肥，促使苗木生长健壮，提高抗病能力。
在4至5月和9至10月赤枯病的发病期，可喷施1比1比200倍波尔多液，或50%退菌特可湿性粉剂500至1000倍液，25%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或抗菌剂401的800倍液，每隔10至15天1次，连续2至3次。