离婚协议房产有贷款的处理方式是双方可以在协议中约定房产归一方所有并由该方继续还贷，对另一方支付的首付，还贷部分和增值部分结合实际情况进行补偿。
一、离婚协议房产有贷款怎么处理
离婚协议房产有贷款的处理方式：可以在离婚协议书中约定离婚时房屋归一方所有，并由该方继续还贷，给另一方首付部分和婚后还贷部分，以及该部分的增值一半的补偿。
根据《民法典》第一千零八十七条规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
二、离婚协议需要公证吗
离婚协议可以公证也可以不公证，因为离婚协议是夫妻双方在民政部门办理完离婚登记手续之后才生效，所以即便是离婚协议已公证了，但双方没有办理离婚手续，离婚协议也不能生效。离婚协议书公证的意义不是很大，没有太多必要性。但是如果当事人为了保险起见也可以选择将离婚协议公证。
三、离婚双方签订的协议书有效吗
离婚双方签订的协议书有效，只要协议内容不违反法律法规，且双方当事人的意思表示真实，那么协议就是有效的。离婚协议书应当载明双方当事人自愿离婚的意思表示以及对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致的意见。
《中华人民共和国民法典》
第四百六十四条 合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。
婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定。