茶尺蠖小rna病毒5’端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小rna病毒的比较分析
发布时间：2024-01-29
用trizol从纯化的茶尺蠖ectropis oblique小rna病毒(eopv)中提取病毒基因组rna，逆转录后加poly(dt)，然后进行两步pcr扩增基因组5’端。克隆测序后，对其5’端非编码区的核苷酸序列进行分析，发现具有哺乳动物小rna病毒的5’端非编码区的一些特征：a／t含量丰富、起始密码子上游aug和小顺反子多。利用mfold预测了eopv5’端非编码区的二级结构，存在4个茎环结构，有哺乳动物内部核糖体进入位点(ires)的保守区域，即含保守基序gnra的茎环a和a／c丰富的环b及多聚嘧啶区域。据此推测eopv基因组翻译采用ires起始机制。完成机构：武汉大学生命科学学院，武汉430072