协议变更合同生效的前提是需要在原来有效的合同关系上进行变更。变更合同时效是根据合同约定的期限而决定的，如合同没有约定，一般情况下为一年时间。
一、协议变更合同生效的前提
协议变更合同生效的前提如下：
1.原已存在有效的合同关系合同变更是在原合同的基础上，通过当事人双方的协商或者法律的规定改变原合同关系的内容。因此，无原合同关系就无变更的对象，合同的变更离不开原已存在合同关系这一前提条件。
2.合同变更须依当事人双方的约定或者依法律的规定并通过法院的判决或仲裁机构的裁决发生合同变更主要是当事人双方协商一致的结果。
二、变更合同时效是多久
可变更合同的期限一般只要是在合同约定的期限内都能变更。根据诚实信用原则，以及维护交易安全的需要，以尽快确定合同当事人之间的权利义务关系。当事人行使变更权的期间应当推定为一年期间。
《民法典》第五百四十一条
撤销权自债权人知道或者应当知道撤销事由之日起一年内行使。自债务人的行为发生之日起五年内没有行使撤销权的，该撤销权消灭。
三、变更合同什么时候生效
变更合同一般自成立时生效。如果该协议是当事人依法订立的，一般自依法成立时生效；如果该协议以办理批准等手续为其生效要件的，则自相关手续完成时生效。
法律依据：
《民法典》第五百零二条 依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。 依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。
第五百三十三条 合同成立后，合同的基础条件发生了当事人在订立合同时无法预见的、不属于商业风险的重大变化，继续履行合同对于当事人一方明显不公平的，受不利影响的当事人可以与对方重新协商。